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Guide 10 février 2026 · 8 min de lecture

Gestion des congés en PME : le guide complet 2026

Découvrez comment organiser efficacement la gestion des congés dans votre PME. Obligations légales, outils, bonnes pratiques et erreurs à éviter.

Pourquoi la gestion des congés est un enjeu stratégique pour les PME

Dans une PME de 10 à 250 salariés, chaque absence impacte directement la productivité. Contrairement aux grandes entreprises qui disposent de services RH dédiés, les PME gèrent souvent les congés de manière artisanale : tableurs Excel, emails, voire cahiers papier.

Résultat : des erreurs de calcul, des conflits entre collaborateurs, et un risque juridique non négligeable en cas de contrôle de l'inspection du travail.

Les obligations légales en France

Le Code du travail français (articles L3141-1 et suivants) encadre strictement les congés payés :

  • 2,5 jours ouvrables par mois de travail effectif, soit 30 jours ouvrables (5 semaines) par an
  • La période de référence court du 1er juin au 31 mai (sauf accord d'entreprise)
  • L'employeur doit informer les salariés de la période de prise des congés au moins 2 mois avant son ouverture
  • Un congé principal d'au moins 12 jours ouvrables consécutifs doit être pris entre le 1er mai et le 31 octobre

Réforme 2024 : arrêts maladie et acquisition de congés

La loi du 22 avril 2024 a profondément modifié les règles d'acquisition des congés pendant les arrêts maladie. Désormais, conformément à la jurisprudence européenne, les périodes d'arrêt maladie non professionnelle ouvrent droit à 2 jours ouvrables de congés par mois (contre 0 auparavant), dans la limite de 24 jours ouvrables par an. Pour les arrêts d'origine professionnelle, le droit reste à 2,5 jours/mois.

De plus, les congés non pris à cause d'un arrêt maladie bénéficient désormais d'un report de 15 mois à compter de la reprise du travail. Cette réforme a un impact direct sur le calcul des soldes de congés et nécessite des outils capables de gérer ces nouvelles règles automatiquement.

Réforme 2026 : le congé supplémentaire de naissance

À compter du 1er juillet 2026, la loi n 2025-1403 (LFSS 2026) crée un nouveau droit : chaque parent pourra prendre 1 ou 2 mois supplémentaires de congé de naissance, indemnisé à 70% du salaire net le 1er mois et 60% le 2e mois. Ce congé s'ajoute aux congés de maternité, paternité et adoption existants. Un impact supplémentaire à anticiper dans la gestion des plannings.

Les obligations légales au Luxembourg

Le droit luxembourgeois, régi par le Code du travail (articles L.233-1 et suivants), prévoit :

  • 26 jours ouvrables de congé annuel minimum (contre 25 en France en jours ouvrés)
  • Des congés extraordinaires légaux : mariage (3 jours), décès d'un parent au 1er degré (3 jours), déménagement (2 jours), etc.
  • Le congé doit être pris en totalité avant le 31 mars de l'année suivante (report limité)
  • Les travailleurs de moins de 18 ans bénéficient de jours supplémentaires

Les 5 erreurs les plus courantes en PME

1. Gérer les congés sur Excel

Un tableur partagé semble simple, mais il ne gère ni les conflits de version, ni les calculs automatiques d'acquisition, ni les workflows de validation. Au-delà de 10 salariés, c'est un risque d'erreur permanent.

2. Ne pas respecter l'ordre des départs

L'article L3141-16 du Code du travail français impose de tenir compte de la situation familiale, de l'ancienneté et de l'activité chez d'autres employeurs pour fixer l'ordre des départs. Ne pas le faire expose à des litiges.

3. Oublier les congés fractionnés

En France, si le congé principal est fractionné (pris en dehors de la période légale du 1er mai au 31 octobre), le salarié a droit à des jours supplémentaires de fractionnement : 1 jour pour 3 à 5 jours pris hors période, 2 jours au-delà de 5 jours.

4. Ne pas archiver les demandes

En cas de litige prud'homal, l'employeur doit prouver que les congés ont bien été accordés et pris. Sans système de traçabilité, c'est parole contre parole.

5. Ignorer les conventions collectives

De nombreuses conventions collectives prévoient des jours supplémentaires (ancienneté, événements familiaux). Ne pas les intégrer dans le calcul expose à des rappels de salaire.

Comment choisir un logiciel de gestion des congés

Voici les critères essentiels pour une PME :

  • Conformité légale : le logiciel doit connaître les règles FR et/ou LU selon votre implantation
  • Workflow de validation : demande → manager → RH, avec notifications automatiques
  • Calcul automatique des soldes : acquisition, report, prorata temps partiel
  • Calendrier d'équipe : vision globale des absences pour anticiper les sous-effectifs
  • Export paie : transfert automatisé vers le logiciel de paie
  • RGPD : hébergement des données en Europe, chiffrement, politique de rétention

Conclusion

La gestion des congés n'est pas un sujet administratif anodin. C'est un enjeu de conformité légale, de satisfaction des collaborateurs et d'efficacité opérationnelle. En 2026, les outils numériques permettent d'automatiser ce processus à moindre coût, même pour les plus petites structures.

Sources :

  • Code du travail français, articles L3141-1 à L3141-33 (Légifrance)
  • Code du travail luxembourgeois, articles L.233-1 à L.233-17 (Legilux)
  • Loi n 2024-364 du 22 avril 2024 portant diverses mesures d'adaptation au droit de l'Union européenne
  • Service-public.fr — Congés payés du salarié
  • Guichet.lu — Congé annuel de récréation

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